在《三生三世枕上书》的原著小说中，东华帝君与凤九的结局是 有情人终成眷属。以下是具体的情节发展：

凤九掉进阿兰若梦境：

凤九为了追随受伤的东华，进入阿兰若的梦境，失去三万年修行，成为阿兰若。在梦境中，阿兰若实际上是凤九为了追随东华而制造的魂魄。

东华的牺牲：

东华为了净化妙义慧明镜，决定牺牲自己，将一半的心剖出做成琉璃戒留给凤九，然后独自面对危险。

重归于好：

凤九在梦境中得知一切真相后，赶往碧海苍灵，与东华重归于好。两人联手击败妖尊缈落，并在命悬一线之际被夜华夫妇、折颜上神和墨渊上神等人搭救。

家庭幸福：

最终，东华与凤九幸福地在一起，并且有了一个儿子名叫白滚滚。东华在与缈落的战斗中重伤发作，凤九用琉璃戒救了他，两人最终相认，白滚滚也确认了东华是他的父君。

综上所述，东华帝君与凤九在经历了一系列的波折和挑战后，最终走到了一起，家庭幸福美满。