在父亲节给男友爸爸发短信问候，可以表达你的感激和祝福，同时展现出你作为未来家庭成员的尊重和关心。以下是一些建议的短信内容：

温馨祝福

“叔叔，父亲节快乐!感谢您培养出了这么优秀的[男友名字]，让我拥有了如此美好的爱情。祝您身体健康，幸福如意!”

感恩之情

“爸爸，您是我生命里永远的太阳，感谢您给予我无尽的爱和支持。在这个特别的日子里，祝您节日快乐，愿您每一天都充满欢笑与温馨。”

回忆与感激

“看着您的目光由严厉变得慈祥，看着您骄健的步伐渐渐变得蹒跚，心中满是感激。父亲节到了，孩儿在远方祝您快乐!”

简洁明了

“叔叔，父亲节快乐!感谢您一直以来的关爱和支持，祝您身体健康，万事如意!”

幽默风趣

“发一条会偷你东西的短信，偷走你的烦恼，偷走你的忧愁，偷走你的失落，偷走你的压力，偷走影响你幸福的一切，爸爸，祝您父亲节快乐!”

深情款款

“爸爸，您的智慧和担当一直是[男友名字]学习的榜样，也让我十分敬佩。在这个特别的日子里，向您送上我最真挚的祝福，愿您笑口常开，健康长寿。”

你可以根据自己的实际情况和与男友爸爸的关系，选择以上建议中合适的内容，适当调整和修改，以表达你内心深处的感激和祝福。